Catedrático de instituto, político y periodista. Licenciado en Física y Química, trabajó en el laboratorio municipal de Madrid a partir de 1898. En 1905 ejerce como auxiliar supernumerario en la Sección de Ciencias del Instituto de Almería, obteniendo la cátedra de Agricultura en 1910. En 1921 es nombrado secretario del Instituto de Almería. Inicia su carrera política en Madrid vinculado a Nicolás Salmerón Alonso, siendo proclamado candidato centrista por el Ayuntamiento de Madrid. Durante su estancia madrileña pertenece a la redacción del periódico salmeroniano La Justicia, del que llegó a ser director en su última etapa. Encabeza en Almería la Agrupación Republicano-Socialista Germinal que dirige en Madrid Nicolás Salmerón García, protagonizando una serie de enfrentamientos con los socialistas locales a partir de 1900. Colabora en el periódico Germinal. En 1901 es uno de los impulsores de la unidad de todas las fuerzas republicanas. Junto a destacados republicanos como José Jesús García y Manuel Abad, forma parte de la Junta Municipal interina que dará paso a la Unión Republicana de Almería, de la que es nombrado vicepresidente en 1903. Entre 1903 y 1905 actúa como presidente del Círculo Republicano. Desde la fundación del diario republicano almeriense El Radical en 1902, actúa como secretario de redacción.

      En 1907 es elegido concejal del Ayuntamiento de Almería junto a los también republicanos Plácido Langle y Francisco López Roldán. Resultado de la división del republicanismo español en 1909, junto a Plácido Langle, constituye el grupo autónomo que posteriormente se integraría en el partido reformista de Melquíades Álvarez. En 1910 se funda el periódico El Popular, del que Manuel Pérez García actúa como director. Más tarde, a partir de 1914, también colabora en el periódico reformista El Día. En las elecciones municipales de 1922 se presenta como candidato del partido reformista, no siendo elegido. La inclusión de Melquíades Álvarez en el Gobierno de concentración liberal hizo pensar a los reformistas almerienses en el posible encasillado de Manuel Pérez García en las elecciones a Cortes de 1923 por el distrito de Sorbas; algo que no llegó a producirse. Con la llegada de la Dictadura de Primo de Rivera, Manuel Pérez García desaparece de la escena política. El Partido Republicano Radical homenajeó la figura de Manuel Pérez García en un acto celebrado en 1933 y una plaza de la ciudad recuerda su figura.